2018年11月，namocell與cz-biohub（chan zuckerburg biohub）合作，在單細(xì)胞測序領(lǐng)域做出了新的嘗試。cz-biohub利用namocell單細(xì)胞分離儀分選出目的b細(xì)胞，并且將其進(jìn)行單細(xì)胞測序，為抗體新藥的發(fā)現(xiàn)邁出了重要一步。
單細(xì)胞rna測序（scrna-seq）作為一種全基因組測序的方式，在單細(xì)胞層面廣泛用于確定細(xì)胞類型和細(xì)胞變異的鑒定。namocell單細(xì)胞分離儀可以通過細(xì)胞標(biāo)記cd27以及一種細(xì)胞活性的染料，來分選出單個(gè)活的b細(xì)胞。通過分析分離后的單細(xì)胞基因表達(dá)情況，對(duì)比靜息記憶b細(xì)胞，可以從單細(xì)胞層面研究基因表達(dá)差異。
圖一，人的未成熟記憶b細(xì)胞在mcd40l-3t3中批量刺激培養(yǎng)6天。收集細(xì)胞并用cd27-pe和celltracker green進(jìn)行細(xì)胞染色。通過namocell單細(xì)胞分離儀篩選pe/fitc雙陽性的細(xì)胞，單細(xì)胞分選至96孔pcr板，分選前pcr板中已預(yù)先鋪好4ul/孔的裂解液。通過cdna合成情況得出單細(xì)胞分選的比例為97%。接下來進(jìn)行vh和vl抗體可變區(qū)域（a，n=8）的特異性基因的擴(kuò)增或者全轉(zhuǎn)錄組文庫制備；通過二代測序獲取序列，參照靜息記憶b細(xì)胞bcr抗體表達(dá)資料組進(jìn)行對(duì)比分析（b）；b細(xì)胞激活基因的差異（c）； 整體基因升降規(guī)律（d）。每孔只有一組bcr轉(zhuǎn)錄物，以及通過sanger測序確定的vh和vl質(zhì)量，都充分說明了分入pcr管中的只有一個(gè)細(xì)胞。
上述實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)確定了分選出來的單細(xì)胞的效率，同時(shí)也驗(yàn)證了通過實(shí)驗(yàn)前期處理和設(shè)門標(biāo)準(zhǔn)得到的確定是激活的b細(xì)胞。更重要的是，來自分選后的單細(xì)胞的cdna適用于后續(xù)的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組文庫制備和免疫球蛋白輕重鏈可變區(qū)域的全長pcr。namocell單細(xì)胞分離儀提供了一種全新的桌面式單細(xì)胞分選平臺(tái)，并且可以與下游單細(xì)胞測序分析無縫對(duì)接。